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很快的，之前在反抗奥兰治亲王的专-制统治中，表现的众志成城的“爱国者党”阵营，迅速分裂成联邦党（民主派）与邦联派（保守派）两种。
就如改革旧的国家议会般，新的国家议会面临几个势力之间的相互冲突：首先是领导主张民主（统一）的势力，连同以前主张联邦制的势力。然而在这两个势力之间观点还是有纷争的，联邦派的势力占居上风，保守的联邦派势力善于议事规则，双方摩擦所产生的冲突氛围中，民主派主张关注民众以及议会之外的政治走向，
也是在这个时候，巴达维亚临时国家议会效仿当时的法国国民议会，被赋予完整的行政能力，以及立法和组织国家机关的权力，并开始堂而皇之的镇压一切宣扬分裂主义与保王党。
在荷兰政治动荡不安的时候，安德鲁告知法国驻荷大使，及法属巴达维亚军团的总指挥莫罗，在巴黎督政-府下达明确指令前，不得公然干涉这个低地国家的政治生活，必须始终保持中立。
1795年底，当法国督政-府依照《1795年宪法》出炉之后，身为法兰西第一个姊妹共和国的巴达维亚共和国，其国民议会中的宪法委员会，也在1796年2月提交了一个新宪法。
这个低地国家在随后开始的公民投票中，最终以赞成对反对的结果，使得巴达维亚《1796年宪法》正式生效。
尽管民主派与保守派之间依然存在各种分歧。例如：政教分离原则，以及少数民族的地位等，但最终还是转变成为两院制的国会，也同时实施间接选举，行政体系如同法国督政府有五位执政。该状况下宪法的修正，就如同公元1795年的法国共和国宪法。
1796年6月5日，巴达维亚的督政-府及两级国会产生。
在法国的影响下，曾是安德鲁在阿登军团的下属，35岁的赫尔曼·威廉·丹德尔斯将军（详见147章），以及后者的亲密战友，36岁地产商人，拉特格·扬·希默尔彭宁克，还有包括德拉克洛瓦在内的三位督政-府执政官，也属于联邦制的支持者或是中立者。
显而易见的，民主派（联邦派）大获全胜。
巴达维亚的督政-府由五位执政官主导，并设有八个部委执行国家的各种事务。包括：外交部、警务部、司法部、财政部、战争部（陆军部）、海军部、文教卫生部、国家经济部（内政部）。
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