汉尼拔成功地绕过了试图阻止他过境的当地人，然后通过转向罗纳河（Rh?ne）山谷，避开了从地中海沿岸行进的罗马军队。
他穿越阿尔卑斯山的确切路线自此成为学术争论的源头（波利比乌斯 [Polybius]，关于汉尼拔战役的最早幸存古代记载，报告称该路线已经存在争议）。
现代影响力最大的理论支持两条路线：
一是沿德罗姆河（Dr?me）山谷行进，并在现代公路南侧的蒙日维尔山口（Col de Montgenèvre）穿越主山脉；
二是进一步北上，沿伊泽尔河（Isère）和阿克河（Arc）山谷，穿越靠近现代的蒙特塞尼山口（Col de Mont Cenis）或小圣伯纳德山口（Little St Bernard Pass）。
最近的证据表明，汉尼拔的军队在马特洪峰（Matterhorn）附近经过。
斯坦福大学的地质考古学家帕特里克·亨特（Patrick Hunt）认为汉尼拔选择了克拉皮耶山口（Col de Clapier），声称该山口最准确地符合古代对路线的描述：可以看到意大利的广阔视野、全年积雪的区域和一个大型营地。
其他学者对此表示怀疑，提出汉尼拔走了更容易的路线，穿越小蒙特塞尼山口。
亨特对此回应，认为汉尼拔的凯尔特向导故意误导了这位迦太基将军。
最近，W. C. 马哈尼（W. C. Mahaney）认为克拉维尔山口（Col de la Traversette）与古代作者的记录最为贴合。
生物地层考古数据强化了克拉维尔山口的案例.
对该山口两侧水流附近的泥炭沼泽进行分析显示，地面被“成千上万，甚至数万只动物和人类”严重干扰，土壤中含有与马和骡子消化道相关的独特克劳斯特里迪亚（Clostridia）细菌痕迹。
放射性碳测年确认了2168 BP或约公元前218年，即汉尼拔进军的年份。
马哈尼等人得出结论，这一证据以及其他证据强烈支持克拉维尔山口为“汉尼拔路线”，正如加文·德·比尔（Gavin de Beer）在1954年所主张的那样。
德·比尔是唯一三位考察过所有阿尔卑斯高山口的解读者之一（其他两位为约翰·拉岑比（John Lazenby）和雅各布·塞贝特（Jakob Seibert）），他们对哪条路线最为合理提出了看法。
德·比尔和塞贝特均选择克拉维尔山口，认为其最接近古代描述。