明神宗时期的政治、文化、经济和军事改革，不仅巩固了中央集权，也促进了社会的全面进步。这些成就不仅在当时产生了深远的影响，也为后世留下了宝贵的经验和教训。明神宗的治国之道，成为了后世帝王学习的典范，其智慧和策略至今仍被学者们广泛研究和讨论。，也对后世产生了重要的启示然而，战争虽已胜利，但余波未平。九菊一派虽被遏制，却并未被彻底铲除。一些残留的教徒暗中蛰伏，伺机报复。
一日，京城中出现多起离奇命案，死者皆呈现诡异死状，似是遭受邪术所致。这消息传入宫中，明神宗大怒，责令锦衣卫彻查。陈璘领命后，深知此事棘手，便找到张居正商议。
张居正认为此事定与九菊一派残党有关，建议再召集昔日众人商讨对策。于是，王阳明出谋划策，从文化思想角度剖析邪教本质；戚继光、李成梁父子则加紧京城防卫部署并训练士兵对抗邪术之法；而明神宗亲自出面安抚民心，倡导百姓相信朝廷定能保大家平安。
众人齐心协力，经过一番艰苦追查与战斗，终于找出隐藏于市井中的九菊一派余孽巢穴。一番激战过后，将其一网打尽。经此一役，明朝更加安稳，明神宗的统治也愈发稳固，他的威望在百姓心中达到顶峰，而这段传奇般的经历永远铭刻于大明的史册之上。。