神医和药王本来并不认识，一个机缘巧合下，两人相识于一场瘟疫。
神医精通医理，对病人的病症判断的十分准确，在药理方面也是世间难寻，开出的药方往往能药到病除且还廉价。
而药王在断病方面比神医略逊一筹，但是药理方面却是胜过神医，对一些疑难杂症，重病怪疾，只要神医断出病因，药王开的药方比神医开的药方更加对症，往往令神医也惊叹不已。
两人在那场瘟疫中相互较劲，都想胜过对方，可偏偏两人各有所长，越是比较就越是被对方的才华所折服。
渐渐的两人从一个不服一个变得相互欣赏，相互敬佩，最终成为了好朋友。
药王想看神医诊病，神医想看药王开的药方。
两人都绝世奇才，一个诊病天下第一，一个配药天下第一。
而且普通的病两人都是观点一致不分高下，疑难杂症两人又都比不上对方的才华，只有两人合作才能将疑难杂症治疗的完美。
可天底下的疑难杂症毕竟有限，两人每治好一种病，就多了一个不分高下的病例，少了一次向对方学习的机会。
于是两人行遍天下，寻找天下怪病，想要合作一部医术，将天下怪病的治疗方法全部记录在册，以图为后人留下断病之法和治疗良方。
尽量让后人少一些错诊误诊，多一些准确诊断，也能对症下药，多挽救一些病人。
最后经历二十多年，江湖纷争，天下大劫终于还是波及到了两人。
有人为救至交好友，心爱之人以两人性命要挟，逼迫两人救人，而有人又为了防止两人救人要杀两人。
还有人开始要杀两人，后来又带着至亲下跪求医。
经历了几场大风波，几生几死下来，药王为救神医断了双腿，神医为保护药王也失去一只手。
且药王在胁迫下为了给人配药伤了眼睛，最终还是药石无灵彻底瞎了。
一个少了一只手，一个双腿被砍断还瞎了，再想走遍天下也不能了，于是两人心灰意冷，只好隐居药王谷，而曾经被两人救过的魔腿张三，鬼枪马涛，风剑王兵，无影针李三娘，排山掌公孙树等高手都甘愿退出江湖，留在两人身边保护两人。
魔腿张三上一届天罡榜排在二十六，鬼枪马涛三十二，风剑王兵三十三。