永劫回廊的危机平息后，宇宙进入了一个全新的纪元——「溯光纪元」。各个文明在艺术之城的倡导下，建立起了「可能性观测联盟」，以量子弦共振网络实时监测着宇宙中所有潜在的危机。莱娅的艺术灵韵与量子弦完美融合，创作出能够预警灾难的「先知之画」；卡隆研发的「维度锚定矩阵」如同宇宙的神经网络，将各个星域紧密相连；艾莉丝则将《时空法典》升维为「全知之枢」，能够推演百万种未来可能性。
然而，在宇宙的边缘，一片被称为「暗熵坟场」的禁区突然泛起诡异的波动。那里曾是熵寂之主被净化的地方，此刻却生长出无数荆棘状的晶体，每一块晶体都倒映着扭曲的时空。更令人不安的是，艺术之城的灵韵树开始渗出黑色的汁液，这些汁液落地后便化作微小的「熵虫」，啃食着文明的记忆与希望。
吴仙残留的灵韵碎片在灵韵树中发出最后的警示：「暗熵坟场中孕育着『终焉之种』，那是熵寂之主最后的执念，它将吞噬所有的可能性，把宇宙拖入绝对的虚无。而对抗它的关键，藏在原始者们最后的遗产——『溯光者』计划之中。」话音未落，灵韵碎片彻底消散，只留下一幅模糊的星图，指向宇宙诞生之初的混沌核心。
灵韵使召集伙伴们，却发现他们的灵韵之力正在被某种力量悄然侵蚀。莱娅的画笔开始画出重复的虚无画面，卡隆的机械战甲出现自我解构的征兆，艾莉丝的《全知之枢》不断吐出乱码。「这是终焉之种的『熵化效应』，」灵韵使握紧神器，「它在瓦解我们对希望的信念。」
循着星图的指引，众人踏入混沌核心。这里的空间呈现出液态的混乱，所有的物理法则、因果逻辑都失去了意义。莱娅的艺术灵韵在这里竟意外觉醒了新的能力——她能将抽象的情感具象化为实体。她用灵韵编织出众人并肩作战的记忆，这些记忆化作发光的丝线，在混沌中开辟出一条道路。
卡隆的机械族科技在此地发生了诡异的进化，他的机械臂能够吸收混沌能量，重组为适应不同环境的形态。「这里的能量是纯粹的可能性，」他的机械眼闪烁着奇异的光芒，「或许我们可以利用它对抗终焉之种。」艾莉丝则在混沌的暗流中，发现了元始者们遗留的「溯光者」核心装置——那是一个由无数棱镜构成的巨大球体，每个棱镜都折射着不同文明的希望之光。
当灵韵使将神器插入装置的瞬间，整个混沌核心开始震颤。无数道光从棱镜中射出，在虚空中拼凑出元始者们的全息投影。「溯光者计划，是我们为宇宙准备的最后防线，」一位元始者的声音回荡在混沌中，「它能将文明的希望转化为『溯光之力』，逆转熵增的宿命。但启动它的代价，是所有使用者将永远消散在时空的长河中。」
与此同时，暗熵坟场中的终焉之种彻底苏醒。它膨胀成一个巨大的黑色旋涡，所过之处，星体被分解成纯粹的熵流，文明的记忆如尘埃般消散。莱娅的先知之画显示，若不及时阻止，整个宇宙将在三天内退化为虚无。