在调解纷争无果后，草薙京等人决定寻找消失的神秘力量，希望借此恢复灵域的平衡。他们在灵域中四处探寻线索，在一座古老的灵塔中发现了一些关于神秘力量的记载。原来，神秘力量源自灵域深处的一个神秘灵泉，灵泉拥有着强大的净化和平衡灵能的作用。但多年前，灵泉被一股邪恶的黑暗灵能所侵蚀，导致其力量逐渐衰弱直至消失。要想恢复神秘力量，必须找到能够净化黑暗灵能的方法。
第六章：净化材料探寻
根据古老记载，要净化黑暗灵能，需要三种稀有的材料：生长在灵域极寒之地的冰晶灵花、栖息在灵域最高峰的雷羽凤凰的羽毛以及蕴含纯净灵能的古老灵晶。草薙京等人再次兵分三路，分别去寻找这三种材料。神乐千鹤带领一队前往灵域极寒之地，那里冰天雪地，环境极为恶劣，到处都是危险的冰灵怪物；八神庵独自前往灵域最高峰，他凭借着强大的实力和独特的暗之力量，不惧途中的艰难险阻；草薙京则带领另一队在灵域的古老遗迹中寻找古老灵晶，遗迹中布满了各种机关和守护灵。
第七章：艰难获取
神乐千鹤一队在极寒之地与冰灵怪物展开激烈战斗。冰灵怪物能够操控冰雪进行攻击，给他们带来了很大的麻烦。但神乐千鹤凭借着精妙的灵术和队友们的紧密配合，逐渐摸清了冰灵怪物的弱点，最终成功采摘到冰晶灵花。八神庵在灵域最高峰遭遇了雷羽凤凰的猛烈攻击。雷羽凤凰拥有强大的雷电力量，每次攻击都伴随着耀眼的雷光和震耳欲聋的轰鸣声。八神庵施展出浑身解数，与雷羽凤凰展开一场恶战。在战斗中，他不断激发自己的暗之力量，最终成功拔下了雷羽凤凰的一根羽毛。草薙京一队在古老遗迹中小心翼翼地破解机关，与守护灵周旋。守护灵拥有强大的灵能护盾，普通攻击对其无效。草薙京通过观察和思考，发现了守护灵的能量来源，成功打破护盾，获得了古老灵晶。
第八章：灵泉净化
三路人员成功集齐三种材料后，迅速返回灵泉所在地。他们将冰晶灵花、雷羽凤凰的羽毛和古老灵晶放入灵泉之中，按照古老记载中的方法进行净化仪式。随着三种材料的融入，灵泉开始发出强烈的光芒，黑暗灵能被逐渐驱散。然而，就在灵泉即将恢复力量之时，一股强大的黑暗势力突然出现，企图破坏净化仪式。这股黑暗势力由一个神秘的黑暗灵主带领，他拥有强大的黑暗灵能，企图独占灵泉的力量。
第九章：最终对决