刘铭传这里进攻长兴，遇上了萧有和，第一天的攻击就以损伤800人，而潦草收场，他希望左宗棠在湖州以东的行动快一点，希望前后夹击萧有和。
而左宗棠这里已经通过俘虏，了解到幼天王洪天贵福就藏身在湖州。于是，他制定了“先剪枝叶、再拔根本” 的战术思想，安排了三路大军进攻湖州外围据点，决心毕其功于一役。擒获幼天王洪天贵福这个功劳自不必多说；湖州这里战略地位的重要性也是一个因素；政治军事竞争的需要也是左宗棠需要考虑的重要原因；还有就是通过军事胜利巩固对浙江的控制权。湖州的陷落标志着浙江全境太平军势力的肃清，为其后续治理东南、推行洋务政策奠定基础。
历史上，左宗棠三路围攻的安排如下：南路主攻，他安排高连升率领楚军主力从德清出发，目标直指湖州第一道防线的菱湖、东林。此路旨在突破太平军外围据点，打开湖州南门的屏障。是南路的主攻力量。
东路佯攻：刘树元与降将蔡元吉统带楚军及部分淮军，从桐乡、乌镇方向逼近，牵制太平军注意力于湖州东郊。蔡元吉部作战勇猛，曾一度突破荻港防线，但遭黄文金反击受挫。
西路截援：左宗棠特别注重切断太平军与皖南的联系，派军监视长兴、安吉一线，试图阻断皖浙交通线。后因兵力不足，联合淮军郭松林部猛攻长兴，最终由淮军攻破长兴，彻底孤立湖州。
不过由于箫有和这个变数的出现，这个时候，左宗棠可以用来围攻湖州的清军人数，洋人军队的人数都较之前有了变化，如历史上郭松林、刘士奇、王永胜、杨鼎勋等率30营淮军进攻长兴如今变成了刘铭传一部。因此他的三路围攻也做了调整。为了确保策略成功，他特意向朝廷上了请求派兵助剿的折子。
为了贯彻军议上“东守西攻，攻淮守楚”的决定，黄文金只能率领城中太平军借助城墙进行死守，凭借其经验，多次击退了清军的进攻，当然，清军也有取得一些进展。