夜幕降临时，地球的星空出现异象。原本璀璨的银河开始扭曲变形，化作一个巨大的三角符号。无数银色光点从符号中坠落，落在世界各地。这些光点接触到地面后，竟变成了机械蜘蛛，它们的腹部闪烁着幽蓝的光芒，所过之处，土壤迅速沙化，植物枯萎成灰。林小羽挥舞光刃斩碎一只蜘蛛，光刃却在接触到蜘蛛核心的瞬间被腐蚀出缺口。
“这些机械蜘蛛的核心能源，是被污染的星核碎片。” 周明轩的机械义眼快速分析，他将受损的机械手臂改装成能量扫描仪，“而且它们在构建某种通讯网络，信号正在向星渊星域传输。” 他调出扫描结果，地球上的蜘蛛群形成的网络，竟与星渊星域的熵锁囚笼产生了共振。
在星渊星域的边缘，一艘造型奇特的飞船缓缓驶入紫光深处。飞船的驾驶舱内，一个身着黑色长袍的身影注视着手中的暗紫色晶体碎片，他的脸上戴着半块银色面具，露出的半张脸布满了与观测者相似的纹路。“陆辰，好戏才刚刚开始。” 他的声音冰冷而沙哑，“当熵锁囚笼的封印彻底解除，你将亲眼见证，所谓的自由意志，不过是一场笑话。”
与此同时，陆辰等人在基因仲裁者旧址发现了初代仲裁者留下的最后讯息。在一面布满裂痕的墙壁上，用古老的基因符文刻着：“星渊深处沉睡着观测者的原罪，唯有集齐七种文明火种，方能照亮救赎之路。” 而在讯息的下方，画着七个神秘的符号，分别代表着宇宙中最古老的七种文明。
“我们要去寻找这些文明火种。” 陆辰握紧拳头，能量结晶在他掌心光芒大盛，“无论前方是怎样的危险，我们都不能让观测者的阴谋得逞。” 他看向伙伴们，林小羽重新燃起斗志，苏晴坚定地点头，周明轩则开始调试武器系统。飞船再次启航，朝着未知的星域飞去，而等待他们的，将是比之前更残酷的挑战，以及隐藏在星渊深处的终极秘密...