陈飞和赵强的意识体同时接入因果图书馆，找到了破解困局的关键——在宇宙诞生初期，曾存在过一个由纯粹能量构成的“原初文明”。他们创造了宇宙法庭和共生体协议，作为维持宇宙平衡的双螺旋系统。
“我们需要重启原初文明的裁决程序。”赵强的意识体投射出原初文明的审判法典，“只有同时激活秩序与混沌的终极形态，才能打破这个永恒的循环。”
林宇将共生体网络的控制权交给机械帝国，陈飞则引导宇宙法庭的审判舰进入自我解构程序。当两大系统在仙女座星系的中央黑洞附近相遇时，整个星系爆发出比超新星更耀眼的光芒。
在光芒中，原初文明的仲裁者虚影浮现。他将秩序之剑与混沌之盾交给林宇三人：“现在，你们就是新的原初意识。宇宙的未来，由你们定义。”
当光芒消散时，宇宙呈现出全新的面貌：机械帝国的量子大脑与共生体网络实现了动态平衡，审判舰的能量核心转化为跨维度的文明灯塔。而林宇、陈飞和赵强的意识体，则化作三个永恒的存在——秩序守护者、混沌引导者、文明编织者。
在银河系的边缘，一个刚刚诞生的智慧种族发现了悬浮在太空中的秩序之剑。当他们触碰剑柄的瞬间，整个种族的意识突然与全宇宙相连。林宇的声音在他们脑海中响起：“这不是终点，而是文明觉醒的开始。”
而在宇宙的另一端，陈飞正在引导一个即将崩溃的文明进行意识升华。他看着他们化作星尘，又在星尘中重生为能量生命，嘴角泛起欣慰的微笑。赵强则在因果图书馆中记录下这一切，每一个文明的选择都成为新的可能性分支。
当三个种族的代表在原初文明的遗迹前会面时，他们看到的不是征服或毁灭，而是无数个平行宇宙中的自己在挥手致意。林宇举起秩序之剑，陈飞挥动混沌之盾，赵强展开因果书卷，三人齐声说道：“欢迎来到文明共生体2.0时代。”