灵界历三千零五年，东海之眼的太虚玄冥塔轰然震动。叶尘立于塔顶，混沌终焉刃插在九黎图腾阵眼，他的太虚境已臻"鸿蒙境"，能透过剑刃看到十二处遗迹的时空乱流正在汇聚成灭世风暴。
"苏瑶，准备催动玄冥终焉镜！"叶尘大喝，他的声音带着鸿蒙之力，震碎了塔身千年玄冰。苏瑶手持玄冥神戟立于塔底，她的玄冥境突破至"永恒境"，戟尖凝聚的玄冥冰晶已能冻结时间长河。
当两人的本源之力同时注入塔身时，太虚玄冥塔突然解体，化作三百六十块混沌玄晶。这些玄晶在虚空中重组为"太虚玄冥轮"，轮盘上十二道星轨分别对应着十二处遗迹的方位。
"原来如此......"苏瑶喃喃自语，"这是混沌之界与灵界的平衡枢纽。"她挥动玄冥神戟，将玄冥本源晶核嵌入轮盘核心。轮盘爆发出耀眼的光芒，在虚空中撕开一道直达混沌之界的通道。
就在此时，黑暗之主的虚影从通道中显现。他的身躯由十二处遗迹的混沌灾种融合而成，每只手臂都握着不同形态的黯灭魔镰碎片。"愚蠢的蝼蚁，以为集齐十二枚天工印就能阻止我？"
叶尘挥动混沌终焉刃，施展出"鸿蒙创世斩"。这一剑劈开了混沌与玄冥的界限，将黑暗之主的身躯斩成两段。然而碎片在玄冥之力中重组，反而吸收了轮盘的平衡能量。
"小心！他在吸收双界本源！"苏瑶急忙催动玄冥终焉镜，镜中显现出所有可能的未来——灵界被黑暗吞噬、混沌之界崩塌、叶尘执刃入魔......
叶尘看到镜中画面，眼中闪过一丝决然。他将混沌终焉刃刺入自己心口，鸿蒙本源化作金色血液，与苏瑶的玄冥灵力融合。在太虚玄冥轮的中央，诞生出一枚由双界本源构成的"鸿蒙玄冥核"。
"苏瑶，用你的永恒境冻结时空！"叶尘大喝。苏瑶挥动玄冥神戟，整个灵界的时间流速骤然减缓。叶尘趁机将鸿蒙玄冥核打入轮盘，轮盘爆发出毁天灭地的能量波动。
黑暗之主的虚影发出凄厉的惨叫，他的身躯在能量风暴中崩解。但在最后时刻，他的一缕残魂附着在叶尘的命魂玉简上，玉简表面浮现出黑色纹路。
"叶尘，你的玉简......"苏瑶担忧地说道。
叶尘握紧玉简，眼中闪过坚定的光芒："这是最后的净化。"他将鸿蒙玄冥核注入玉简，玉简爆发出璀璨的光芒，黑色纹路彻底消失。
当光芒消散时，叶尘与苏瑶发现自己置身于混沌之界的"鸿蒙玄冥殿"。殿中悬浮着十二座水晶棺，里面躺着的正是上古时期的九黎祖巫与玄冥祖巫。
"我们的使命完成了......"太虚圣龙的龙魂突然显现，"现在，你们可以选择成为新一任的混沌之主与玄冥之主，或者......"