晶核危机暂解后，混元盟在各星域布下的监测网络却愈发频繁地捕捉到异常波动。在大麦哲伦星系边缘，一片被称作 “永夜之渊” 的黑暗区域中，突然浮现出一座悬浮的暗紫色宫殿。宫殿由无数菱形晶体拼接而成，表面流转着幽光，每一道棱面都倒映着扭曲的时空画面，时而闪过古神的狰狞面容，时而映出纪元议会的机械大军。
林轩带领林晚晴、影、王虎等人驾驶星渊方舟靠近时，一股无形的压迫感扑面而来。方舟的防护罩自动启动，金黑色光芒与暗紫色宫殿的雾气接触的瞬间，竟发出滋滋的腐蚀声响。“这股气息…… 比之前遇到的晶核更纯粹。” 林晚晴的混沌灵根剧烈跳动，本源结晶的血色符文与暗紫色雾气产生诡异共鸣，她的瞳孔中甚至映出宫殿深处若隐若现的巨大祭坛。
星渊方舟刚进入宫殿引力范围，导航系统便陷入混乱，仪表盘上的坐标疯狂跳转，最终定格在宫殿核心的某个未知区域。更诡异的是，船舱内的空气开始凝结成暗紫色的丝线，这些丝线如同活物般缠绕在众人身上，试图侵入他们的经脉。王虎挥起新改造的 “混元震荡斧”，将缠绕而来的丝线震碎，但更多丝线从四面八方涌来。
“小心，这些丝线带着古神的意志烙印！” 林轩的混元天道剑出鞘，剑身上的创世符文光芒大盛。金黑色剑气所到之处，暗紫色丝线纷纷消散，但宫殿深处却传来一阵低沉的笑声，仿佛无数冤魂在同时开口：“玄天仙尊，终于来了……” 随着声音落下，宫殿的地面突然裂开，无数暗紫色机械傀儡破土而出。这些傀儡的关节处缠绕着混沌锁链，胸口镶嵌着与晶核同源的紫色晶体，它们手中的武器闪烁着幽光，每一次挥动都能撕裂空间。
影的青玄剑残片发出清鸣，她化作一道青光冲入傀儡群。剑魄所化的青光与傀儡的武器相撞，爆发出的能量余波震碎了周围的晶体墙壁。但傀儡们的晶体核心在受损后竟能快速重组，断肢处瞬间长出新的机械部件。林晚晴见状，将本源结晶的力量注入混沌灵根，血色符文化作锁链缠绕住傀儡，试图限制其行动。然而，傀儡胸口的晶体突然发出强光，锁链在光芒中开始腐蚀断裂。
王虎抡起混元震荡斧，斧刃上的紫金色光芒与傀儡的攻击碰撞，爆发出震耳欲聋的轰鸣。他每一次攻击都能震碎几个傀儡，但更多傀儡从地面的裂缝中涌出。“这样下去不是办法，根本杀不完！” 王虎的喘息声中带着焦急，他的战甲在傀儡的攻击下出现多处破损。
林轩的神识在混乱中不断探寻，发现这些傀儡的行动皆由宫殿深处的祭坛操控。他锁定祭坛方位，周身混元之力疯狂运转，背后的混元法相再次显现。“混元破障！” 法相挥动混元天道剑，一道贯穿天地的金色剑气斩出，剑气所过之处，晶体墙壁纷纷炸裂，开辟出一条通往祭坛的道路。但众人刚踏入通道，两侧的墙壁突然伸出无数暗紫色触手，这些触手顶端布满尖刺，刺尖上滴落着腐蚀性液体。