“抓住它！”神秘人的声音从井底传来，这次带着真实的焦急。小美在坠落瞬间抓住生锈的链条，看见下方齿轮组中央悬浮着水晶棺，里面躺着和她长得一模一样的少女，后颈没有芯片，胸口戴着和怀表同款的齿轮徽章——那是真正的林小羽，未被改造的本体。
“她才是第一次重生的你。”执行董事的机械臂卡住井沿，“我们用她的基因克隆出你，现在该让正版回归了。”水晶棺突然启动，透明盖子缓缓打开，林小羽的睫毛颤动，后颈浮现出和小美相同的蝴蝶胎记。
小美突然想起神秘人说的“三次重生机会”——第一次是车祸后用克隆体续命，第二次是意识觉醒挣脱芯片控制，现在第三次机会就在眼前：要么让本体苏醒，自己作为实验体消失；要么摧毁水晶棺，永远被困在齿轮井。
怀表突然从井壁弹回，齿轮盖上的“77”发出强光。小美接住它的瞬间，水晶棺的齿轮锁开始转动，密码盘浮现出“19:07”的倒影。当她把怀表按在密码盘上时，整座钟楼发出地动山摇的轰鸣，齿轮井的链条开始回收，林小羽的身体逐渐升起。
“你在干什么？！”执行董事的机械臂挥来，小美侧身避开，看见06号的齿轮滚进水晶棺，启动了自毁程序。红色警报灯亮起时，她终于看清井底的壁画——父亲和01号实验体（那个疤痕女）站在齿轮装置前，旁边写着：“用第三齿连接过去与未来”
链条在最后一刻绷直。小美抱着林小羽的身体撞出井口，06号的齿轮在水晶棺爆炸中化为齑粉，执行董事的机械臂被崩塌的齿轮组碾碎。当她们跌回圆形房间时，十二面镜子只剩下中央那面，映出两个重叠的身影，后颈的芯片同时发出齿轮转动声。
“对不起，我来晚了。”林小羽睁开眼，声音带着不属于这个时代的沧桑，她摸向小美后颈，那里不知何时多了道齿轮状的疤痕，“爸爸用最后的时间改写了程序，现在我们共享记忆枢纽，第三次重生的钥匙……”
钟楼顶端的铜钟突然发出裂响，半截齿轮从塔顶坠落，正好砸在中央镜面。小美看见镜中倒影分裂成两半：一半是带着实验体编号的自己，另一半是未被改造的林小羽，两者中间悬浮着怀表的齿轮，第三齿正在缓缓修复。